Clostridium difficile to beztlenowa bakteria, która wywołuje rzekomobłoniaste zapalenie jelita grubego oraz jest częstą przyczyną biegunki poantybiotykowej. Kluczowym czynnikiem ryzyka zakażenia C. difficile jest antybiotykoterapia, która zaburza prawidłową florę jelitową. Do przeprowadzenia badania potrzebne jest pobranie próbki kału.